เมื่อวันที่ 23 พฤษภาคม พ.ศ. 2506 ได้มีประกาศในราชกิจจานุเบกษา ให้ใช้พระราชบัญญัติ 3 ฉบับ ให้มีการจัดตั้งกระทรวงพัฒนาการแห่งชาติขึ้นใหม่ โดยการรวมงานของกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ที่มีอยูู่่เดิมเข้าไว้กับกรมอื่นอีกรวมทั้งหมด 13 กรม ซึ่งกรมพัฒนาที่ดิน เป็นกรมหนึ่งที่ได้รับการจัดตั้งในครั้งนี้ด้วย
วันที่ 29 กันยายน พ.ศ. 2515 คณะปฏิวัติอันมี จอมพลถนอม กิตติขจร เป็นหัวหน้าได้้ยุบกระทรวงพัฒนาการแห่งชาติและแบ่งส่วนราชการใหม่เพื่อให้เหมาะสมกับสถานการณ์ปัจจุบัน จึงได้มีประกาศคณะปฏิวัติ เล่มที่ 276 ลงวันที่ 29 กันยายน 2515 และประกาศในราชกิจานุเบกษาฉบับพิเศษ เล่มที่ 89 ตอนที่ 145 ลงวันที่ 29 กันยายน 2515 ให้กรมพัฒนาที่ดิน กรมชลประทาน และกรมส่งเสริมสหกรณ์ ย้ายมาสังกัด กระทรวงเกษตรและสหกรณ์
