สถานีพัฒนาที่ดินปราจีนบุรี ได้ก่อตั้งเมื่อปี พ.ศ. 2542 ตั้งที่ทำการอยู่ที่ ศูนย์ราชการจังหวัดปราจีนบุรี หมู่ 11 ตำบลไม้เค็ด อำเภอเมือง จังหวัดปราจีนบุรี ตามนโยบายของกรมพัฒนาที่ดิน จนถึง ปี พ.ศ.2549สถานีพัฒนาที่ดินปราจีนบุรี ได้ดำเนินการขอใช้พื้น ที่สาธารณะ
ประโยชน์ที่ ตำบลเนินหอม อำเภอเมือง จังหวัดปราจีนบุรี จำนวน23 ไร่ แต่ยังไม่ได้ก่อสร้างอาคารสำนักงาน มีเพียงโรงเก็บพัสดุและบ้านพักคนงานระดับ 1-2
ปัจจุบันสถานีพัฒนาที่ดินปราจีนบุรี
ได้จัดตั้งอยู่ที่ 135/1 หมู่ 5 ตำบลเนินหอม อำเภอเมือง จังหวัดปราจีนบุรี 25230